Fagdirektøren leier fagavdelinga. Ho/han er medlem i administrerande direktør sin stab, der ho/han er medisinsk-fagleg rådgjevar.
I tillegg har fagavdelinga støttefunksjonar for arbeidet med forsking og utvikling, kvalitetsarbeid og utdanning av helsepersonell og opplæring av pasientar og pårørande. Fagavdelinga har ansvaret for dei pasientretta datasystema, men den tekniske drifta av desse ligg i ein eigen organisasjon (Hemit). Avdelinga har ansvaret for det systematiske arbeidet med smittevern, for prestetenestene og for bibliotektilbodet.